Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SFT2D1Q8WV19 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms