Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GIPC3Q8TF64 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GIPC3Q8TF64 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms