Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMO3Q8TAP4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMO3Q8TAP4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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