Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF548Q8NEK5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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