Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CCDC63Q8NA47 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC63Q8NA47 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms