Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9U0

TC2N, Tandem C2 domains nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TC2NQ8N9U0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TC2NQ8N9U0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TC2NQ8N9U0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms