Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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RNF182Q8N6D2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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RNF182Q8N6D2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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RNF182Q8N6D2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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RNF182Q8N6D2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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RNF182Q8N6D2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RNF182Q8N6D2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RNF182Q8N6D2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RNF182Q8N6D2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RNF182Q8N6D2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF182Q8N6D2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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