Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SVOPQ8N4V2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms