Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms