Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPUSD2Q8IZ73 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPUSD2Q8IZ73 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms