Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC50Q8IVM0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms