Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
P3H3Q8IVL6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
P3H3Q8IVL6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms