Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBEC3FQ8IUX4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOBEC3FQ8IUX4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3FQ8IUX4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC3FQ8IUX4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms