Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM50Q86XT4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM50Q86XT4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms