Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNMB4Q86W47 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms