Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC84Q86UT8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC84Q86UT8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms