Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CLNKQ7Z7G1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLNKQ7Z7G1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms