Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6J0

SH3RF1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF1Q7Z6J0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3RF1Q7Z6J0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3RF1Q7Z6J0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms