Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT28Q7Z3Y7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT28Q7Z3Y7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
KRT28Q7Z3Y7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT28Q7Z3Y7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT28Q7Z3Y7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT28Q7Z3Y7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT28Q7Z3Y7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT28Q7Z3Y7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT28Q7Z3Y7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT28Q7Z3Y7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT28Q7Z3Y7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT28Q7Z3Y7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms