Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
USP43Q70EL4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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