Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
CASC2Q6XLA1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms