Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A10Q6U841 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A10Q6U841 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A10Q6U841 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A10Q6U841 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A10Q6U841 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A10Q6U841 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A10Q6U841 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A10Q6U841 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A10Q6U841 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A10Q6U841 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A10Q6U841 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A10Q6U841 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A10Q6U841 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A10Q6U841 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC4A10Q6U841 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms