Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC174Q6PII3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms