Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM88Q6PEY1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM88Q6PEY1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms