Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ANKRD54Q6NXT1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ANKRD54Q6NXT1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms