Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
REEP3Q6NUK4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms