Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RCSD1Q6JBY9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RCSD1Q6JBY9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RCSD1Q6JBY9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RCSD1Q6JBY9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RCSD1Q6JBY9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms