Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPPQ6IPU0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPPQ6IPU0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms