Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATL3Q6DD88 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATL3Q6DD88 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms