Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPATA1Q5VX52 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPATA1Q5VX52 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms