Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TAF3Q5VWG9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF3Q5VWG9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms