Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC30Q5VVM6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC30Q5VVM6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms