Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
WDR78Q5VTH9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR78Q5VTH9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms