Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPRD2Q5VT52 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
RPRD2Q5VT52 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RPRD2Q5VT52 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms