Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYCP2LQ5T4T6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms