Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NUP188Q5SRE5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NUP188Q5SRE5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms