Protein–RNA interactions for Protein: Q5PR19

Putative UPF0607 protein LOC392364, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5PR19 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5PR19 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q5PR19 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q5PR19 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q5PR19 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5PR19 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5PR19 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5PR19 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5PR19 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5PR19 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5PR19 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5PR19 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5PR19 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5PR19 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5PR19 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5PR19 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5PR19 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5PR19 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5PR19 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q5PR19 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5PR19 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5PR19 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5PR19 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5PR19 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5PR19 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5PR19 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5PR19 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5PR19 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5PR19 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5PR19 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5PR19 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5PR19 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5PR19 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5PR19 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q5PR19 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5PR19 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5PR19 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5PR19 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5PR19 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5PR19 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5PR19 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5PR19 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5PR19 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5PR19 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5PR19 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5PR19 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5PR19 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q5PR19 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms