Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PCID2Q5JVF3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PCID2Q5JVF3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms