Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KHDC3LQ587J8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KHDC3LQ587J8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms