Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TPRNQ4KMQ1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
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