Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP28Q4G0W2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP28Q4G0W2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms