Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRFIP1Q32MZ4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRRFIP1Q32MZ4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms