Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM71Q2Q1W2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM71Q2Q1W2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms