Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFX7Q2KHR2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFX7Q2KHR2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms