Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC142Q17RM4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC142Q17RM4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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