Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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