Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
NREPQ16612 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NREPQ16612 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NREPQ16612 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NREPQ16612 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NREPQ16612 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NREPQ16612 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NREPQ16612 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NREPQ16612 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
NREPQ16612 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NREPQ16612 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NREPQ16612 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
NREPQ16612 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
NREPQ16612 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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NREPQ16612 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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NREPQ16612 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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NREPQ16612 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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NREPQ16612 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NREPQ16612 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NREPQ16612 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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NREPQ16612 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NREPQ16612 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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NREPQ16612 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NREPQ16612 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NREPQ16612 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NREPQ16612 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NREPQ16612 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NREPQ16612 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NREPQ16612 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NREPQ16612 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
NREPQ16612 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
NREPQ16612 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
NREPQ16612 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
NREPQ16612 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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