Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDB1Q16531 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DDB1Q16531 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
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