Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKN1Q16512 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKN1Q16512 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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