Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CST6Q15828 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CST6Q15828 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST6Q15828 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST6Q15828 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST6Q15828 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CST6Q15828 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST6Q15828 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST6Q15828 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST6Q15828 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST6Q15828 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST6Q15828 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CST6Q15828 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST6Q15828 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST6Q15828 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST6Q15828 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CST6Q15828 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CST6Q15828 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CST6Q15828 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms